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Yusuke Himeoka's web page
Talks
論文: 作品
2022
空間分割された細胞モデルにおける触媒反応ネットワークの分業の進化
一井俊介, 姫岡優介, 古澤力, 日本物理学会第 77 回年次大会, 2022年 3 月
代謝ネットワークの構造によるジェネラリスト・スペシャリスト戦略の出現
新美倫太郎,古澤力,姫岡優介, 日本物理学会第 77 回年次大会, 2022年 3 月
細胞分化の階層性と不可逆性:状態空間におけるアトラクターの分布との対応
中村能之, 姫岡優介, 斉藤稔, 古澤力, 日本物理学会第 77 回年次大会, 2022年 3 月
人工的な代謝ネットワークの緩和特性とネットワーク構造
姫岡優介, 御手洗菜美子, Julius Bier Kirkegaard, Sandeep Krishna, 日本物理学会第 77 回年次大会, 2022年 3 月
Emergence of growth and dormancy from
a kinetic model of the Escherichia coli central carbon metabolism
Yusuke Himeoka and Namiko Mitarai, Oral Presentation,
Major ideas in quantitative microbial physiology: Past, Present and Future, 13th-15th June, Copenhagen, Denmark
2021
細胞モデルにおける内部構造の自発形成と成長速度の増大
一井俊介, 姫岡優介, 古澤力, 日本物理学会 2021年秋季大会, 2021年 9月
遺伝子制御ネットワークと細胞分化の遷移ルールの対応
中村能之, 姫岡優介, 斉藤稔, 古澤力, 日本物理学会 2021年秋季大会, 2021 年 9 月
大腸菌代謝動力学における緩和軌道の多様性
姫岡優介, 御手洗菜美子, 日本物理学会 2021年秋季大会, 2021年9月
2020
When to wake up? The optimal waking-up strategies for starvation-induced persistence
Yusuke Himeoka and Namiko Mitarai, Poster Presentation, Discussion Meeting on Conflict and Cooperation in Cellular Populations (CCCP 2020), 3rd-5th February, Bangalore, India
2019
Degradation of ribosomal RNA during
long-term carbon starvation and phosphorus starvation
Yusuke Himeoka, Bertil Gummesson, Michael A. Sørensen, Sine Lo Svenningsen, and Namiko Mitarai, UBI Seminar,
17th October, Universal Biology Institute, University of Tokyo
Simulating the evolution of bacterial metabolic networks
Yusuke Himeoka and Namiko Mitarai, Oral Presentation, School on Computational Mathematical Modeling, 28th March,
Geilo, Norway
Dynamics of bacterial populations under the feast-famine cycles
Yusuke Himeoka and Namiko Mitarai, Oral Presentation, the 74th Annual Meeting of Japanese Physical Society,
Kyushu University, 17th March, Fukuoka, Japan
2018
Theory for Transitions Between Exponential and Stationary Phases:
Universal Laws for Lag Time
Yusuke Himeoka and Kunihiko Kaneko, Oral Presentation,
EMBO Workshop on Optimizations and trade-off in cell growth and survival,
Weizmann Institute of Science, 27th February, Rehovot, Israel
2017
Theory for Transitions Between Exponential and Stationary Phases:
Universal Laws for Lag Time
Yusuke Himeoka and Kunihiko Kaneko, Seminar, Nieals Bohr Institute, November, Copenhagen, Denmark
Theory for Transitions Between Exponential and Stationary Phases:
Universal Laws for Lag Time
Yusuke Himeoka and Kunihiko Kaneko, Poster Presentation, EMBO Conference Quantitative Principles in Biology,
EMBL Heidelberg, November, Heibelberg, Germany
A model for cells in Lag and Stationary Phase
2015
Yusuke Himeoka and Kunihiko Kaneko, Oral presentation, The 55th annual Meeting of The Biophysical Society of Japan, Kumamoto University, September, Kumamoto, Japan
A model for cells in Lag and Stationary Phase
Yusuke Himeoka and Kunihiko Kaneko, Oral presentation, The joint symposium of CREST·PRESTO·QBiC in 2017,
"Molecular mechanisms and mathematics of dynamics of living things", RIKEN QBiC, March, Osaka, Japan
2016
Transitions among Log, Dormant, and Death Phases :
Proposition of a simple model and quantitative characterization of dormancy and lag time
Yusuke Himeoka and Kunihiko Kaneko, Flush Talk, Quantitative Laws 2 -From Physiology to Ecology-, June, Como Italy
A model for cells in Lag and Stationary Phase
Yusuke Himeoka and Kunihiko Kaneko, Oral Presentation, From physics universality to biological universality,
Tokyo University, August, Tokyo, Japan
Lag,Stationary Phaseの細胞モデル
姫岡優介,金子邦彦, 口頭, 日本物理学会2016年秋季大会, 金沢大学, 9月, 石川
Pirt方程式成立条件の探索
姫岡優介,金子邦彦, 口頭, 日本物理学会第71回年次大会, 東北学院大学, 3月, 東京
The Growth/Death transition in self-replicating polymer system
Yusuke Himeoka and Kunihiko Kaneko, Winter School on Quantitative Systems Biology 2015, ICTS, December,
Bangalore, India
The Growth/Death transition in self-replicating polymer system
Yusuke Himeoka and Kunihiko Kaneko, Poster presentation,Bacterial Expressions II, NCBS, December, Bangalore, India
代謝の切り替えが収率に与える影響
姫岡優介,金子邦彦, 口頭, 日本物理学会2015年秋大会, 大阪大学, 9月, 東京
簡単な細胞モデルを用いたPirt方程式の導出
姫岡優介,金子邦彦, 口頭, 日本生物物理学会第53回年次大会, 金沢大学, 9月, 石川
Derivation of the Pirt equation in the simple cell model
Yusuke Himeoka and Kunihiko Kaneko, Poster presentation,High-Dimensional data for the design principles of life,
RIKEN QBiC, August, Oosaka, Japan
振動する酵素による代謝の効率
姫岡優介,金子邦彦, 口頭, 日本物理学会第70回年次大会, 早稲田大学, 3月, 東京
2014
触媒反応系における最適成長速度
姫岡優介,金子邦彦, 口頭, 日本物理学会2014年秋大会, 中部大学, 9月, 愛知
触媒反応系における最適成長速度
セミナー, 大阪大学, 4月, 大阪
Optimal uptake rate of nutrient for the thermodynamically efficient cellular growth
Yusuke Himeoka and Kunihiko Kaneko, Poster presentation,The second annual winter q-bio meeting Hawaii, February, Hawaii
2013
自己触媒反応系におけるRobustnessとRedundancy
ポスター, 口頭, 第58回物性若手夏の学校, 8月, 滋賀
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